Хотелось понять, извлекается ли zip-файл в Windows, а затем копируются извлеченные файлы (WINSCP) на компьютер LINUX.
Есть ли какие-либо проблемы в Linux, связанные с форматом файла?
scp не преобразует файл никоим образом; нет разницы между извлечением файла в одной системе и его переносом в целевую систему с помощью scp по сравнению с извлечением файла непосредственно в целевой системе (при условии, что не возникло ошибок при передаче).