В Jira нет API "Python", есть REST API, который можно вызывать с любого языка. Если вы используете библиотеку типа "jira-python", вы можете прочитать документы здесь относительно аутентификации.
Если вы используете локальную проверку Jira на странице документации , касающуюся аутентификации, вы можете использовать аутентификацию на основе файлов cookie.
Если вы используете облако Jira, проверьте эту документацию страницу, касающуюся аутентификации с помощью токенов.