Вы изменили IRI импорта в исходной онтологии?
Если IRI не изменяется, Protege не будет загружать вашу измененную онтологию, а будет использовать исходную онтологию из исходного IRI.
Если IRI был изменен, но логический IRI онтологии (т. Е. Упомянутый в файле) такой же, возможно, что Protege использует другую копию исходной онтологии.
Лучший вариант действий для этого сценария - убедиться, что измененная онтология имеет новый логический IRI и доступен для другого IRI, а затем использовать этот IRI для импорта. Также убедитесь, что вы сохраняете и перезагружаете свою онтологию импорта - разрешение импорта выполняется при загрузке, а не при редактировании существующего импорта.