rgdal не будет устанавливаться на AWS RStudio AMI - PullRequest
Новая
       34

rgdal не будет устанавливаться на AWS RStudio AMI

0 голосов
/ 04 июля 2018

Мне удалось успешно запустить самый последний экземпляр RStudio AWS EC2 (louisaslett.com, RStudio-1.1383_R-3.4.2… ubuntu-16.04-LTS-64). В этом случае R работает в основном так, как ожидалось, и я могу установить и открыть несколько пакетов. Однако я получаю сообщение об ошибке, если я пытаюсь установить один из пакетов rgdal из gdalUtils.

Ниже приведен вывод консоли, когда я пытаюсь установить rgdal. Вывод для установки gdalUtils слишком длинный, чтобы включить его здесь, но оба содержат текст «ошибка: обновите GDAL до 1.11.4 или более поздней версии», который, как я подозреваю, является проблемой, но не имеет понятия, как ее исправить. Любые мысли или советы будут с благодарностью.

Приветствия 

> install.packages("rgdal")
Installing package into ‘/home/rstudio/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4’
(as ‘lib’ is unspecified)
trying URL 'https://cran.rstudio.com/src/contrib/rgdal_1.3-3.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 1670656 bytes (1.6 MB)
==================================================
downloaded 1.6 MB
* installing *source* package ‘rgdal’ ...
** package ‘rgdal’ successfully unpacked and MD5 sums checked
checking for g++... g++
checking whether the C++ compiler works... yes
checking for C++ compiler default output file name... a.out
checking for suffix of executables... 
checking whether we are cross compiling... no
checking for suffix of object files... o
checking whether we are using the GNU C++ compiler... yes
checking whether g++ accepts -g... yes
configure: CC: gcc -std=gnu99
configure: CXX: g++
configure: rgdal: 1.3-3
checking for /usr/bin/svnversion... yes
configure: svn revision: 759
checking whether g++ supports C++11 features by default... no
checking whether g++ supports C++11 features with -std=gnu++11... yes
configure: C++11 support available
checking for gdal-config... /usr/bin/gdal-config
checking gdal-config usability... yes
configure: GDAL: 1.11.3
checking GDAL version >= 1.11.4... no
configure: error: upgrade GDAL to 1.11.4 or later
ERROR: configuration failed for package ‘rgdal’
* removing ‘/home/rstudio/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/rgdal’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘rgdal’ had non-zero exit status
The downloaded source packages are in
        ‘/tmp/RtmpGUxbcA/downloaded_packages’

1 Ответ

0 голосов
/ 05 июля 2018

С тех пор я столкнулся с той же проблемой при запуске Rstudio в облаке Google. В обоих случаях решение было относительно простым - установить последний, но более старый пакет rgdal из cran (https://cran.r -project.org / src / contrib / Archive / rgdal / ), который не зависел от самого последнего gdal библиотеки, и, следовательно, установлены без выдачи ошибки об обновлении GDAL.

...