У меня ушел день на поиск документации о том, как это сделать. Мысль, которой я поделюсь со всеми вами.
Добавьте ваши аргументы в ваш jSON-файл ПАРАМЕТРЫ ПОЛЬЗОВАТЕЛЯ следующим образом:
"python.linting.flake8Args": [
"--max-line-length=120",
"--ignore=E402,F841,F401,E302,E305",
],