Большинство, если не все, производители устройств на базе Windows CE предлагают область постоянного хранения и процедуру сброса к заводским настройкам / автоматической установки.
Если устройство загружено в чистом / холодном режиме, «нормальная» область хранения сбрасывается на заводские настройки по умолчанию. Таким образом, все пользовательские приложения и изменения удаляются. Когда устройство загружается, происходит процесс автоматической установки, характерный для OEM. Вам необходимо интегрировать ваши настройки с автоматической установкой.
Пожалуйста, посетите страницу поддержки Datalogic Memor X3 и посмотрите руководство пользователя о том, как сохранить ваше приложение с этим устройством Datalogic (я бы сделал это для вас, но они требуют регистрации).
ОБНОВЛЕНИЕ: см. https://www.manualslib.com/manual/850035/Datalogic-Memor-X3.html?page=64#manual и прочитайте о сохранении сеанса и сохранении настроек.
По крайней мере, вы можете использовать SD-карту со специальной папкой (например, 2577 для устройств с процессором ARM) и пользовательским файлом autorun.exe внутри. Это будет выполняться автоматически при каждой загрузке.