Это не сам фильтр SVG, а тот факт, что вы ссылаетесь на него через фильтр CSS. Некоторые примитивы фильтра SVG не работают при вызове из CSS-фильтра в Mac / iOS Safari. Если вы примените этот фильтр непосредственно к фигуре SVG, он будет работать нормально. Например:
<svg id="svgeffects">
<defs>
<filter class="safari_only" id="liquify">
<feTurbulence baseFrequency="0.015" numOctaves="3" result="warp" type="fractalNoise"></feTurbulence>
<feDisplacementMap id="liquid" in="SourceGraphic" in2="warp" scale="35" xChannelSelector="R" yChannelSelector="B"></feDisplacementMap>
</filter>
</defs>
<rect x="10" y="10" width="50" height="50" filter="url(#liquify)"/>
</svg>