Проблема была вовсе не в импорте.
Я допустил ошибку при использовании медиазапросов.
У обоих файлов был один и тот же медиазапрос, так как они оба были для настольного CSS (отсюда и «d»). Тем не менее, второй, в container-d-1.less, переписал первый и сдул все мои миксины! Мне явно нужно заключить блок импорта в один медиазапрос для этого раздела вместо того, чтобы повторно выделять его внутри каждого файла поменьше.