Я не вижу проблемы. Когда вы используете / Force corflags обновляет PE-заголовок, чтобы сборка была x86 (32-разрядная), однако это делает недействительным строгое именование, и, следовательно, вы должны отказаться от измененной сборки. Вот почему вы видите предупреждение, но я бы поспорил, что corflags изменяет сборку.
Если не использовать / Force, то corflags говорит вам, что не будет делать что-то, что сделает сборку недействительной, если вы явно не дадите ей разрешение с аргументом / Force.