Указание случайного эффекта, вложенного во взаимодействие фиксированных эффектов - PullRequest
0 голосов
/ 11 ноября 2018

Вероятно, легкий.

У меня есть данные с фиксированными и случайными эффектами, которые я бы хотел совместить с моделью смешанных эффектов:

set.seed(1)

df <- data.frame(group = c(rep("A",40),rep("B",40)),
                 treatment = rep(c(rep("T",20),rep("CT",20)),2),
                 class = c(rep("AT1",10),rep("ACT1",10),rep("AT2",10),rep("ACT2",10),rep("BT1",10),rep("BCT1",10),rep("BT2",10),rep("BCT2",10)),
                 value = rnorm(80),
                 stringsAsFactors = F)

df$group <- factor(df$group, levels = c("A","B"))
df$treatment <- factor(df$treatment, levels = c("CT","T"))

Фиксированные эффекты - group и treatment, а случайный эффект - class, который, на мой взгляд, вложен в комбинации group и treatment.

Модель, которую я хочу установить:

value ~ group*treatment

Где эффект интереса, если group:treatment взаимодействие. Конечно, я хочу учитывать class как случайный эффект, но я не могу найти синтаксис для этого. Я старался: (1|group*treatment/class) и (1|group:treatment/class), но оба дают ошибку.

Определение столбца group:treatment в df:

df <- df %>% dplyr::mutate(group_treatment = paste0(group,"_",treatment))

И примерка:

fit <- lmer(value ~ group*treatment + (1|group_treatment/class), data = df)

Кажется, это работает, но мне интересно, если это единственный способ или есть более явный синтаксис для таких случаев случайного вложения эффекта.

Есть идеи?

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...