Я хотел разделить 7-й столбец (header-otherinfo), как показано ниже, на «:», а затем вставить четвертый, шестой и седьмой символы из этого разделенного столбца после второго столбца как отдельные столбцы с разными заголовками.
Входной файл будет таким с несколькими строками
Chr Start End Ref Alt Func. otherinfo
1 21 32 T C int 0/1:71:67:66:45:21:31.82%:7.1741E-8:33:34:45:0:21:0
2 22 31 T C int 0/1:77:45:44:22:21:48.84%:1.8298E-8:31:35:22:0:21:0
3 23 30 T C int 0/1:87:40:38:9:21:70%:1.7919E-9:32:36:9:0:21:0
4 24 29 G T int 0/1:68:23:23:3:15:65.22%:1.4655E-7:40:33:3:0:15:0
5 25 28 C T int 1/1:55:17:17:4:13:76.47%:2.5647E-6:30:21:4:0:13:0
6 26 27 T C int 1/1:60:15:15:2:13:86.67%:8.7675E-7:38:24:2:0:13:0
7 27 26 C T int 0/1:181:1067:1067:1003:64:6%:6.9582E-19:39:39:1003:0:64:0
8 28 25 C A int 1/1:46:9:9:0:9:100%:2.0568E-5:0:38:0:0:9:0
9 29 24 T A int 0/1:255:356:356:170:186:52.25%:3.2158E-71:40:40:0:170:0:186
10 30 23 T G int 1/1:41:8:8:0:8:100%:7.77E-5:0:40:0:0:0:8
11 31 22 G A int 0/1:148:92:92:51:41:44.57%:1.387E-15:40:39:51:0:41:0
12 32 21 G C int 0/1:122:51:51:20:31:60.78%:5.6397E-13:36:35:20:0:31:0
тогда как выходной файл должен выглядеть следующим образом
Chr Start RD AD Per End Ref Alt Func.
1 21 66 21 31.82% 32 T C int
2 22 44 21 48.84% 31 T C int
3 23 38 21 70% 30 T C int
4 24 23 15 65.22% 29 G T int
5 25 17 13 76.47% 28 C T int
6 26 15 13 86.67% 27 T C int
7 27 1067 64 6% 26 C T int
8 28 9 9 100% 25 C A int
9 29 356 186 52.25% 24 T A int
10 30 8 8 100% 23 T G int
11 31 92 41 44.57% 22 G A int
12 32 51 31 60.78% 21 G C int
Я пытался использовать awk для разделения
awk 'BEGIN {OFS=FS="\t"} {gsub(/\:/,"\t",$7)}1' input.txt >> output.txt
и получил этот вывод
Chr Start End Ref Alt Func. otherinfo
1 21 32 T C int 0/1:71:67:66:45:21:31.82%:7.1741E-8:33:34:45:0:21:0
2 22 31 T C int 0/1:77:45:44:22:21:48.84%:1.8298E-8:31:35:22:0:21:0
3 23 30 T C int 0/1:87:40:38:9:21:70%:1.7919E-9:32:36:9:0:21:0
4 24 29 G T int 0/1:68:23:23:3:15:65.22%:1.4655E-7:40:33:3:0:15:0
5 25 28 C T int 1/1:55:17:17:4:13:76.47%:2.5647E-6:30:21:4:0:13:0
6 26 27 T C int 1/1:60:15:15:2:13:86.67%:8.7675E-7:38:24:2:0:13:0
7 27 26 C T int 0/1:181:1067:1067:1003:64:6%:6.9582E-19:39:39:1003:0:64:0
8 28 25 C A int 1/1:46:9:9:0:9:100%:2.0568E-5:0:38:0:0:9:0
9 29 24 T A int 0/1:255:356:356:170:186:52.25%:3.2158E-71:40:40:0:170:0:186
10 30 23 T G int 1/1:41:8:8:0:8:100%:7.77E-5:0:40:0:0:0:8
11 31 22 G A int 0/1:148:92:92:51:41:44.57%:1.387E-15:40:39:51:0:41:0
12 32 21 G C int 0/1:122:51:51:20:31:60.78%:5.6397E-13:36:35:20:0:31:0
Пожалуйста, дайте мне знать, если я смогу это сделать?
Заранее спасибо