Добро пожаловать в Stackoverflow :)
Как я вижу, они говорят вам сделать что-то подобное.
$ mkdir newRepo
$ cd newRepo
$ git init
Создайте новый репозиторий в вашей учетной записи GitHub
$ git remote add origin https://github.com/yourusername/reponame.git
$ git remote add mavlink https://github.com/mavlink/qgroundcontrol.git
$ git pull mavlink
$ git push origin master
Они пытаются рассказать вам, как обновить репо новыми функциями, которые они добавляют к основному репо.
То же самое можно сделать с помощью разветвления. Как я понял, чтобы следовать этому уроку, вы должны будете следовать по этому пути.