Сертификат содержит только публичный сертификат. Ничто не может помешать вам использовать личный ключ для любых вещей, которые вы хотите с ним сделать.
Как уже говорилось ранее, сертификат должен использоваться другой стороной - после того, как вы что-то подписали или зашифровали, другая сторона должна принять решение, если она им довольна. Затем он проверяет сертификат и его флаги, чтобы убедиться, что его можно использовать для операции в соответствии с политикой, установленной для другой стороны.