Преобразование файлов NIFTI в DICOM с использованием Python - PullRequest
0 голосов
/ 23 января 2019

Я хотел бы преобразовать набор файлов nifti в формат dicom, используя скрипт на python.Я знаю, что есть какое-то изящное решение для преобразования dicom в nifti (dcm2nii), но я не нашел ничего подобного, чтобы сделать обратное.Я пытался работать с med2image, но при попытке использовать он генерирует огромное количество исключений.Кто-нибудь может помочь?

1 Ответ

0 голосов
/ 23 января 2019

Вы можете использовать SimpleITK , вот пример кода для изменения и записи файлов DICOM.

Вам нужно будет сохранить слайс за слайсом, если изображение 3D, как вы видите по предоставленной ссылке.

Для чтения просто используйте filtered_image = sitk.ReadImage("file.nii") вместо filtered_image = sitk.DiscreteGaussian(image3D) и продолжайте выполнение сценария с этой точки.

...