Неправильное использование R пакета reshape2 для печати с ggplot2? - PullRequest
Новая
       11

Неправильное использование R пакета reshape2 для печати с ggplot2?

0 голосов
/ 25 января 2019

Я хотел бы построить некоторые данные с помощью ggplot2.Мои данные изначально в широкоформатном формате, и поэтому я хотел бы сначала преобразовать их в длинный формат.

Каким-то образом «melt» создает таблицу, которую я не могу использовать с ggplot2 по желанию.Я предполагаю, что я использую это неправильно, но я, к сожалению, не мог выяснить, как решить проблему.

Я хотел бы построить переменные s1 и s2 в зависимости от длины волны.Это минимальный наполовину рабочий пример: 

#Generate fake data:
data <- cbind(wavelength = seq(1,10), s1 = seq(21,30), s3 = seq(41,50))

#Convert to long format:
#install.packages("reshape2")
library(reshape2)
datLong <- melt(data          = data,
            id.vars       = c("wavelength"),
            measure.vars  = c("s1","s2"),
            variable.name = "variable",
            value.name    = "value")

#install.packages("ggplot2")
library("ggplot2")

#The following delivers the error "Error: Attempted to create layer with no stat."
 ggplot(data = datLong, mapping = aes(x = wavelength, y = value)) + layer(geom = "point") 

#This plots something, but it seems that "melt" produced a wrong format as wavelength, s1, s2 are on the x-axis.
ggplot() + layer(data = datLong, mapping = aes(x=Var2, y=value), geom = "point", stat = "identity", position_dodge(width = 3))

Было бы очень здорово, если бы вы могли объяснить проблему.

Большое спасибо!

1 Ответ

0 голосов
/ 25 января 2019

Это то, что вы имели в виду? 

library(ggplot2)
library(dplyr)
library(tidyr)
#or just library(tidyverse)
as.tibble(data) %>% 
  gather("Var","Val",-wavelength) %>% 
  ggplot(mapping = aes(x = wavelength, y = Val,col=Var)) + geom_point()

Использование reshape2 и tidyverse

as.tibble(data) %>% 
  melt(id.vars=c("wavelength")) %>% 
  ggplot(mapping = aes(x = wavelength, y = value,col=variable)) + geom_point()
...