просто добавьте -f в ваш код в режиме графического интерфейса после перехода в папку bin
Вот код:
jmeter -f -n -t "templates \ Lucene_search1.jmx" -l "templates \ Lucene_Search_Results_Data1.csv" -e -o "C: \ Запуск Python \ apache-jmeter-5.0 \ HTML_Reports"