Данные на самом деле не хранятся в Amazon Athena. Вместо этого Amazon Athena просматривает данные, хранящиеся в Amazon S3, и выполняет запросы к ним.
Поэтому, если вы просто хотите необработанные данные , просто скопируйте файлы непосредственно из S3. Simple!
Однако, если вы хотите выполнить запрос в Amazon Athena и экспортировать / манипулировать результатами , вы можете использовать документацию Athena - Boto 3 Docs для вызова Athena из Python.