Добавить линию регрессии в GenePlot в Seurat - PullRequest
0 голосов
/ 21 ноября 2018

Я делаю генно-генный корреляционный анализ с Seurat на определенном кластере моих данных scRNAseq, и я хотел бы добавить линию регрессии к моему графику.Вот что я сделал:

TSNEPlot(object = SampleA,do.label=TRUE) 
WhichCells(object = SampleA, ident = "2")
SampleA2.subset <- SubsetData(object = SampleA, ident.use = c("2")) #2 is my cluster of interest
GenePlot(YSa2.subset, "Itgam", "Elf1")

Я считаю, что мне нужно использовать функцию abline, но я не могу заставить ее работать в Seurat.Кто-нибудь имел такую ​​же проблему и может мне помочь?Или есть другой способ сделать это, о котором я не знаю?

Большое спасибо за ваше время!

...