tSNE с группами разного размера - уменьшить набор данных или установить недоумение = самая большая группа? - PullRequest
0 голосов
/ 22 ноября 2018

Построение набора данных протеома с помощью tSNE Я сталкиваюсь с проблемой, что у меня большая здоровая группа (70) и довольно мало образцов на группу генотипа (3-8).Как я должен установить недоумение в этом случае?Или лучше отделить здоровые случаи от больных (они четко разделены в PCA, евклидово)?

Большое спасибо!Себастьян

Побочный квест: будете ли вы использовать для визуализации данные с поправкой на партии или скорее без исправления?Для PCA исправленные выглядят намного лучше, но мне интересно, будет ли использование его в tSNE более подходящим?

...