Невозможно собрать пакет R с кодом OpenCL и C ++ в Windows - PullRequest
Новая
       35

Невозможно собрать пакет R с кодом OpenCL и C ++ в Windows

0 голосов
/ 31 января 2019

Я пытаюсь создать минимальный пакет R, содержащий как код OpenCL, так и код C ++ под Windows 7, с картой Nvidia, R 3.5.1, Rtools35: https://github.com/WhateverLiu/tryOpenCLcppCode, но он не работает.

Тем не менее, нет проблем с созданием пакета с той же структурой, но содержащего только код C и OpenCL: https://github.com/WhateverLiu/tryOpenCLcCodeOnly. Функция пакета работает отлично.

Ниже приведены журналы компилятора от сборки двух пакетов..

С кодом C, успешно: 

* installing to library 'C:/Program Files/R/R-3.5.1/library'
* installing *source* package 'tryGPU' ...
** libs
C:/RBuildTools/3.5/mingw_64/bin/gcc  -I"C:/PROGRA~1/R/R-35~1.1/include" -DNDEBUG  -I"C:/Program Files/R/R-3.5.1/library/Rcpp/include"        -O2 -Wall  -std=gnu99 -mtune=generic -c openclcode.c -o openclcode.o
C:/RBuildTools/3.5/mingw_64/bin/gcc -shared -s -static-libgcc -o tryGPU.dll tmp.def openclcode.o -LC:/Windows/System32 -lOpenCL -LC:/PROGRA~1/R/R-35~1.1/bin/x64 -lR
installing to C:/Program Files/R/R-3.5.1/library/tryGPU/libs/x64
** R
** byte-compile and prepare package for lazy loading
No man pages found in package  'tryGPU' 
** help
*** installing help indices
** building package indices
** testing if installed package can be loaded
* DONE (tryGPU)
In R CMD INSTALL

С кодом C ++ не удалось: 

* installing to library 'C:/Program Files/R/R-3.5.1/library'
* installing *source* package 'tryGPU' ...
** libs
C:/RBuildTools/3.5/mingw_64/bin/g++ -shared -s -static-libgcc -o tryGPU.dll tmp.def RcppExports.o openclcode.o -LC:/Windows/System32 -lOpenCL -LC:/PROGRA~1/R/R-35~1.1/bin/x64 -lR
d000055.o:(.idata$5+0x0): multiple definition of `__imp___C_specific_handler'
d000052.o:(.idata$5+0x0): first defined here
C:/RBuildTools/3.5/mingw_64/bin/../lib/gcc/x86_64-w64-mingw32/4.9.3/libstdc++.a(pure.o):(.text$__cxa_pure_virtual+0x17): undefined reference to `write'
C:/RBuildTools/3.5/mingw_64/bin/../lib/gcc/x86_64-w64-mingw32/4.9.3/libstdc++.a(pure.o):(.text$__cxa_deleted_virtual+0x17): undefined reference to `write'
C:/RBuildTools/3.5/mingw_64/bin/../lib/gcc/x86_64-w64-mingw32/4.9.3/libstdc++.a(basic_file.o):(.text$_ZN12_GLOBAL__N_1L6xwriteEiPKcx+0x29): undefined reference to `write'
C:/RBuildTools/3.5/mingw_64/bin/../lib/gcc/x86_64-w64-mingw32/4.9.3/libstdc++.a(basic_file.o):(.text$_ZNSt12__basic_fileIcE8sys_openEiSt13_Ios_Openmode+0x36): undefined reference to `fdopen'
C:/RBuildTools/3.5/mingw_64/bin/../lib/gcc/x86_64-w64-mingw32/4.9.3/libstdc++.a(basic_file.o):(.text$_ZNSt12__basic_fileIcE2fdEv+0x8): undefined reference to `fileno'
C:/RBuildTools/3.5/mingw_64/bin/../lib/gcc/x86_64-w64-mingw32/4.9.3/libstdc++.a(basic_file.o):(.text$_ZNSt12__basic_fileIcE6xsgetnEPcx+0x2b): undefined reference to `read'
collect2.exe: error: ld returned 1 exit status
no DLL was created
ERROR: compilation failed for package 'tryGPU'
* removing 'C:/Program Files/R/R-3.5.1/library/tryGPU'
* restoring previous 'C:/Program Files/R/R-3.5.1/library/tryGPU'
In R CMD INSTALL

Exited with status 1.

Я думаю, что способ смешивания кода C и C ++ правильный (используя extern "C" {}), но, кажется, однажды g++ вмешивается, возникают конфликты, которые я не совсем понимаю.

Я пытался повторно реализовать программу с привязками OpenCL C ++, но компилятор выдает точно такую ​​же ошибку.

Любая помощь, ответившая на вопрос или предложившая мне указания, была бы очень признательна !!

...