Нет. Плагин Eclipse - это пакет OSGi, для которого требуется взаимодействие с множеством вещей, которые, насколько я вижу, не могут быть реализованы в Jython.
Если вы хотите избежать Java, вы можете взглянуть на другие вещи, нацеленные на JVM, но вам придется выяснить, можете ли вы производить и потреблять конкретные элементы, необходимые для вызова необходимых вещей и вызова их нужными способами.