varimp (R partykit) возвращает ошибки для установки условной важности - PullRequest
0 голосов
/ 24 мая 2018

Во-первых, я построил модель по

cf1 <- cforest(y~., data = DATA, strata = DATA$y,
           ntree = 200L, mtry = 10)

Здесь, учитывая, что набор данных очень несбалансирован (y=1 занимает 7% всех наблюдений), поэтому я добавляю strata здесь, чтобы убедиться, что наблюденияс y=1 не игнорируются в упаковке.cf1 работает нормально, с точки зрения матрицы путаницы.Тем не менее, когда я попытался реализовать выбор функции с помощью

cf1.imp_cond <- varimp(cf1, conditional = TRUE)

Возвращается

Error in x[strata == s] <- .resample(x[strata == s]) : 
NAs are not allowed in subscripted assignments

Я не могу понять, что означает эта ошибка.Кто-то встречал это раньше?

---- update

Вот манипулированные данные испытаний из исходного набора данных, который я использую.Вот код

cf2 <- cforest(X5_years_survival~., data = test, strata = X5_years_survival,
           ntree = 200L, mtry = 6)
cf2.imp_cond <- varimp(cf2, conditional = TRUE)

Тем не менее, у меня есть ошибка:

Error in x[strata == s] <- .resample(x[strata == s]) : 
NAs are not allowed in subscripted assignments

--- update

Ошибка возникает при применении функции kidids_node.

1 Ответ

0 голосов
/ 25 мая 2018

Правда в том, что, если я сохраню все ковариаты типа integer, вместо преобразования их в as.factor, применение varimp не вызывает ошибок.

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...