Создайте проект со всеми вашими библиотеками и работайте, загрузите библиотеку packrat и вызовите функцию bundle ()
library(packrat)
bundle()
Это создаст файл projname.tar.gz
Скопируйте этот файл ивставьте в папку проекта вашего сервера и вызовите функцию unbundle следующим образом, bundle = имя вашего пакета и "."означает распаковать здесь, в этой папке
library(packrat)
unbundle(bundle="packlib.tar.gz",where=".")