Если вы обработаете ваш документ, вы увидите что-то вроде этого:
Пустая строка плюс перед вторым "Ответом" вместе с отступомделает уценку интерпретировать это как код.В RStudio разделы кода показаны серым шрифтом.В выводе PDF используется шрифт фиксированной ширины, и **
трактуются буквально, а не интерпретируются как команды для полужирного.
Поскольку между третьей и четвертой «ответами» нет пустой строки, этирассматриваются как один абзац, что делает отступы несущественными.
Решение: Не делать отступ, а только код.