OMP: ошибка № 15: инициализация libiomp5.dylib, но найденная libiomp5.dylib уже инициализирована - PullRequest
Новая
       11

OMP: ошибка № 15: инициализация libiomp5.dylib, но найденная libiomp5.dylib уже инициализирована

0 голосов
/ 06 декабря 2018

Я пытаюсь запустить тестовую программу, чтобы проверить, правильно ли настроена моя среда Anaconda.Однако, когда я запускаю свою тестовую программу, я получаю это сообщение об ошибке, когда программа настраивает график (точнее, обратный вызов on_train_end()):

OMP: Ошибка № 15: Инициализация libiomp5.dylib,но найденный libiomp5.dylib уже инициализирован.OMP: Подсказка Это означает, что было несколько копий среды выполнения OpenMP, поскольку это может ухудшить производительность или привести к неверным результатам.Лучшее, что можно сделать, - убедиться, что в процесс включена только одна среда выполнения OpenMP, например, избегая статического связывания среды выполнения OpenMP в любой библиотеке.В качестве небезопасного, неподдерживаемого, недокументированного обходного пути вы можете установить переменную среды KMP_DUPLICATE_LIB_OK = TRUE, чтобы позволить программе продолжить выполнение, но это может привести к сбоям или молча приводить к неверным результатам.Для получения дополнительной информации см. http://www.intel.com/software/products/support/.

Я запускаю тестовую программу на моем MacBook Pro 15 "2015, где установлен macOS Mojave 10.14.1. Дистрибутив Anaconda, который я сейчас установилis https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda2-5.3.0-MacOSX-x86_64.sh.

Вот тестовая программа: 

#!/usr/bin/env python

import numpy as np
import tensorflow as tf
import matplotlib.pyplot as plt

from tensorflow import keras

Xs = np.array([
    [0, 0],
    [0, 1],
    [1, 1],
    [1, 0]
])

Ys = np.array([
    [0],
    [1],
    [0],
    [1]
])

class MyCallback(keras.callbacks.Callback):
    def __init__(self):
        super(MyCallback, self).__init__()
        self.stats = []

    def on_epoch_end(self, epoch, logs=None):
        self.stats.append({
            'loss': logs['loss'],
            'acc': logs['acc'],
            'epoch': epoch
        })

    def on_train_end(self, logs=None):
        loss_x = []
        loss_y = []
        acc_x = []
        acc_y = []
        for e in self.stats:
            loss_x.append(e['epoch'])
            loss_y.append(e['loss'])
            acc_x.append(e['epoch'])
            acc_y.append(e['acc'])
        plt.plot(loss_x, loss_y, 'r', label='Loss')
        plt.plot(acc_x, acc_y, 'b', label='Accuracy')
        plt.xlabel('Epochs')
        plt.ylabel('Loss / Accuracy')
        plt.legend(loc='upper left')
        plt.show()

with tf.Session() as session:
    model = keras.models.Sequential()

    model.add(keras.layers.Dense(10, activation=keras.activations.elu, input_dim=2))
    model.add(keras.layers.Dense(1, activation=keras.activations.sigmoid))

    model.compile(optimizer=keras.optimizers.Adam(lr=0.05),
                  loss=keras.losses.mean_squared_error,
                  metrics=['accuracy'])

    model.fit(x=Xs, y=Ys, batch_size=4, epochs=50, callbacks=[MyCallback()])

    print("Training complete")

    loss, acc = model.evaluate(Xs, Ys)

    print(f"loss: {loss} - acc: {acc}")

    predictions = model.predict(Xs)

    print("predictions")
    print(predictions)

Я уже пытался исправить проблему, связанную с ответом из this связанный с этим вопрос. Таким образом, добавив следующие строки кода после раздела import: 

import os
os.environ['KMP_DUPLICATE_LIB_OK'] = 'True'

Я получаю еще одно сообщение об ошибке, это полная трассировка стека: 

2018-12-06 10:18:34.262 python[19319:371282] -[NSApplication _setup:]: unrecognized selector sent to instance 0x7ff2b07a3d00
2018-12-06 10:18:34.266 python[19319:371282] *** Terminating app due to uncaught exception 'NSInvalidArgumentException', reason: '-[NSApplication _setup:]: unrecognized selector sent to instance 0x7ff2b07a3d00'
*** First throw call stack:
(
        0   CoreFoundation                      0x00007fff2ccf0e65 __exceptionPreprocess + 256
        1   libobjc.A.dylib                     0x00007fff58d47720 objc_exception_throw + 48
        2   CoreFoundation                      0x00007fff2cd6e22d -[NSObject(NSObject) __retain_OA] + 0
        3   CoreFoundation                      0x00007fff2cc92820 ___forwarding___ + 1486
        4   CoreFoundation                      0x00007fff2cc921c8 _CF_forwarding_prep_0 + 120
        5   libtk8.6.dylib                      0x0000000b36aeb31d TkpInit + 413
        6   libtk8.6.dylib                      0x0000000b36a4317e Initialize + 2622
        7   _tkinter.cpython-36m-darwin.so      0x0000000b3686ba16 _tkinter_create + 1174
        8   python                              0x000000010571c088 _PyCFunction_FastCallDict + 200
        9   python                              0x00000001057f2f4f call_function + 143
        10  python                              0x00000001057f0abf _PyEval_EvalFrameDefault + 46847
        11  python                              0x00000001057e4209 _PyEval_EvalCodeWithName + 425
        12  python                              0x00000001057f3b1c _PyFunction_FastCallDict + 364
        13  python                              0x000000010569a8b0 _PyObject_FastCallDict + 320
        14  python                              0x00000001056c1fe8 method_call + 136
        15  python                              0x00000001056a1efe PyObject_Call + 62
        16  python                              0x0000000105743385 slot_tp_init + 117
        17  python                              0x00000001057478c1 type_call + 241
        18  python                              0x000000010569a821 _PyObject_FastCallDict + 177
        19  python                              0x00000001056a2a67 _PyObject_FastCallKeywords + 327
        20  python                              0x00000001057f3048 call_function + 392
        21  python                              0x00000001057f0b6f _PyEval_EvalFrameDefault + 47023
        22  python                              0x00000001057f330c fast_function + 188
        23  python                              0x00000001057f2fac call_function + 236
        24  python                              0x00000001057f0abf _PyEval_EvalFrameDefault + 46847
        25  python                              0x00000001057e4209 _PyEval_EvalCodeWithName + 425
        26  python                              0x00000001057f3b1c _PyFunction_FastCallDict + 364
        27  python                              0x000000010569a8b0 _PyObject_FastCallDict + 320
        28  python                              0x00000001056c1fe8 method_call + 136
        29  python                              0x00000001056a1efe PyObject_Call + 62
        30  python                              0x00000001057f0cc0 _PyEval_EvalFrameDefault + 47360
        31  python                              0x00000001057e4209 _PyEval_EvalCodeWithName + 425
        32  python                              0x00000001057f33ba fast_function + 362
        33  python                              0x00000001057f2fac call_function + 236
        34  python                              0x00000001057f0abf _PyEval_EvalFrameDefault + 46847
        35  python                              0x00000001057f330c fast_function + 188
        36  python                              0x00000001057f2fac call_function + 236
        37  python                              0x00000001057f0abf _PyEval_EvalFrameDefault + 46847
        38  python                              0x00000001057e4209 _PyEval_EvalCodeWithName + 425
        39  python                              0x00000001057f33ba fast_function + 362
        40  python                              0x00000001057f2fac call_function + 236
        41  python                              0x00000001057f0abf _PyEval_EvalFrameDefault + 46847
        42  python                              0x00000001057e4209 _PyEval_EvalCodeWithName + 425
        43  python                              0x00000001057f33ba fast_function + 362
        44  python                              0x00000001057f2fac call_function + 236
        45  python                              0x00000001057f0b6f _PyEval_EvalFrameDefault + 47023
        46  python                              0x00000001057e4209 _PyEval_EvalCodeWithName + 425
        47  python                              0x00000001057f33ba fast_function + 362
        48  python                              0x00000001057f2fac call_function + 236
        49  python                              0x00000001057f0abf _PyEval_EvalFrameDefault + 46847
        50  python                              0x00000001057e4209 _PyEval_EvalCodeWithName + 425
        51  python                              0x00000001057f33ba fast_function + 362
        52  python                              0x00000001057f2fac call_function + 236
        53  python                              0x00000001057f0abf _PyEval_EvalFrameDefault + 46847
        54  python                              0x00000001057e4209 _PyEval_EvalCodeWithName + 425
        55  python                              0x00000001057f33ba fast_function + 362
        56  python                              0x00000001057f2fac call_function + 236
        57  python                              0x00000001057f0b6f _PyEval_EvalFrameDefault + 47023
        58  python                              0x00000001057e4209 _PyEval_EvalCodeWithName + 425
        59  python                              0x00000001057f33ba fast_function + 362
        60  python                              0x00000001057f2fac call_function + 236
        61  python                              0x00000001057f0b6f _PyEval_EvalFrameDefault + 47023
        62  python                              0x00000001057e4209 _PyEval_EvalCodeWithName + 425
        63  python                              0x000000010583cd4c PyRun_FileExFlags + 252
        64  python                              0x000000010583c224 PyRun_SimpleFileExFlags + 372
        65  python                              0x0000000105862d66 Py_Main + 3734
        66  python                              0x0000000105692929 main + 313
        67  libdyld.dylib                       0x00007fff59e1608d start + 1
        68  ???                                 0x0000000000000002 0x0 + 2
)
libc++abi.dylib: terminating with uncaught exception of type NSException

Вот список связанных зависимостей, установленных в среде (для краткости не связанные зависимости опущены): 

Name                |     Version                      Build
--------------------|----------------|----------------------
_tflow_select       |     2.3.0      |                   mkl
blas                |     1.0        |                   mkl
intel-openmp        |     2019.1     |                   144
matplotlib          |     3.0.1      |        py36h54f8f79_0
mkl                 |     2018.0.3   |                     1
mkl_fft             |     1.0.6      |        py36hb8a8100_0
mkl_random          |     1.0.1      |        py36h5d10147_1
numpy               |     1.15.4     |        py36h6a91979_0
numpy-base          |     1.15.4     |        py36h8a80b8c_0
tensorboard         |     1.12.0     |        py36hdc36e2c_0
tensorflow          |     1.12.0     |    mkl_py36h2b2bbaf_0
tensorflow-base     |     1.12.0     |    mkl_py36h70e0e9a_0

Ответы [ 2 ]

0 голосов
/ 09 декабря 2018

В большинстве случаев это решает проблему: 

conda install nomkl
0 голосов
/ 07 декабря 2018

У меня был похожий опыт, и опубликованные в другом месте решения не помогли мне.В конце концов я получил разблокировку, понизив мою версию matplotlib, то есть conda install matplotlib=2.2.3

...