Как вы сказали, метод удаления требует идентификатор сообщения и удаляет только одно сообщение.Существует метод get , но он не поддерживает возврат всех сообщений.Если все сообщения, которые вы удаляете, были сгенерированы самим ботом, я бы посоветовал вам вести журнал регистрации идентификаторов сообщений и использовать его для их удаления.Я не верю, что бот может удалить сообщение, сгенерированное другим пользователем или ботом, отличным от него, так же, как пользователь не может удалить сообщение другого пользователя.