Организовать файл с AWK

Question

Ну, у меня есть следующий файл:

Progeny Sire    Dam    Sex  PENAS       P35         P41
13254   11908   11421   M   47.275811   1322.828674 1719.183748
13323   11335   11386   M   43.29896    1225.57111  1634.436447
13562   11864   11895   M   47.884191   1228.568357 1615.427502
13338   11335   11970   M   45.780973   1196.32757  1561.900145

Мне нужно транспонировать PENAS, P35 и P41 столбцы.Эти столбцы будут новым столбцом: возраст.Визуально мне нужно, чтобы этот файл был таким:

Progeny Sire    Dam     Sex AGE     Peso
13254   11908   11421   M   PENAS   47.275811
13254   11908   11421   M   P35     1322.828674
13254   11908   11421   M   P41     1719.183748
13323   11335   11386   M   PENAS   43.29896
13323   11335   11386   M   P35     1225.57111
13323   11335   11386   M   P41     1634.436447
13562   11864   11895   M   PENAS   47.884191
13562   11864   11895   M   P35     1228.568357
13562   11864   11895   M   P41     1615.427502
13338   11335   11970   M   PENAS   45.780973
13338   11335   11970   M   P35     1196.32757
13338   11335   11970   M   P41     1561.900145

Я пробовал эту команду, но она не работала:

awk 'NR==1{h=$1 OFS $2 OFS $3 OFS $4 OFS $5 OFS $6 OFS $7; next}
            {a[$2]=(($1 in a)?(a[$1] OFS $NF):(OFS $5 OFS $6 OFS $7 OFS "AGE"));
             if(!($7 in b)) {h=h OFS $7; b[$7]}}
        END{print h; for(k in a) print k,a[k]}' a.txt | column -t > b

И я застрял на этом этапе, любые предложения, пожалуйста?Благодарю.Обратите внимание, что мой оригинальный набор состоит из 1400 строк.

Answer 1

При использовании GNU awk для gensub ():

$ cat tst.awk
BEGIN { numPfx=4 }
{ pfx = gensub("((\\S+\\s+){"numPfx"}).*","\\1",1) }
NR==1 {
    split($0,ages)
    print pfx, "AGE", "Peso"
    next
}
{
    for (i=numPfx+1; i<=NF; i++) {
        print pfx, ages[i], $i
    }
}

$ awk -f tst.awk file | column -t
Progeny  Sire   Dam    Sex  AGE    Peso
13254    11908  11421  M    PENAS  47.275811
13254    11908  11421  M    P35    1322.828674
13254    11908  11421  M    P41    1719.183748
13323    11335  11386  M    PENAS  43.29896
13323    11335  11386  M    P35    1225.57111
13323    11335  11386  M    P41    1634.436447
13562    11864  11895  M    PENAS  47.884191
13562    11864  11895  M    P35    1228.568357
13562    11864  11895  M    P41    1615.427502
13338    11335  11970  M    PENAS  45.780973
13338    11335  11970  M    P35    1196.32757
13338    11335  11970  M    P41    1561.900145

При использовании других awk вы просто замените gensub () на переменную plus sub () и замените \\S на [^[:space:]] и * 1006.* с [[:space:]].

Answer 2

вот еще один awk, не зависящий от количества столбцов ...

$ awk 'NR==1{n=split($0,h); 
             for(i=1;i<=NF-3;i++) printf "%s", $i OFS; 
             printf "%s\n", "AGE" OFS "Peso"; next} 
            {split($0,p); 
             NF--; 
             for(i=1;i<=3;i++) 
               {$(NF-1)=h[NF-2+i]; 
                $NF=p[NF-2+i]; 
                print}}' file | column -t


Progeny  Sire   Dam    Sex  AGE    Peso
13254    11908  11421  M    PENAS  47.275811
13254    11908  11421  M    P35    1322.828674
13254    11908  11421  M    P41    1719.183748
13323    11335  11386  M    PENAS  43.29896
13323    11335  11386  M    P35    1225.57111
13323    11335  11386  M    P41    1634.436447
13562    11864  11895  M    PENAS  47.884191
13562    11864  11895  M    P35    1228.568357
13562    11864  11895  M    P41    1615.427502
13338    11335  11970  M    PENAS  45.780973
13338    11335  11970  M    P35    1196.32757
13338    11335  11970  M    P41    1561.900145

Answer 3

После awk может также помочь здесь.

awk '
FNR==1{
  for(i=5;i<=NF;i++){
    a[++h]=$i};
  NF-=2;
  $NF="AGE Peso";
  print;
  next}
{
  for(j=5;j<=NF;j++){
    printf("%s %s %s %s %s %s\n",$1,$2,$3,$4,a[++k],$j);
    k=j==NF?k="":k}
}' Input_file | column -t

Answer 4

Я бы сделал это так:

transpose.awk

NR == 1 { 
  NF     -= 2         # Remove last two header columns
  $NF     = "AGE"     # Add AGE column header
  $(NF+1) = "Peso"    # Add Peso column header
  print               # Print header
  next                # Skip to next line
}

{
  for (i=5; i<=7; i++) {
    if(i==5) s = "PENAS"
    if(i==6) s = "P35"
    if(i==7) s = "P41"

    print $1, $2, $3, $4, s, $i
  }
}

Запустите его, например, так:

awk -v OFS='\t' -f transpose.awk infile

Вывод:

Progeny Sire    Dam     Sex AGE     Peso
13254   11908   11421   M   PENAS   47.275811
13254   11908   11421   M   P35     1322.828674
13254   11908   11421   M   P41     1719.183748
13323   11335   11386   M   PENAS   43.29896
13323   11335   11386   M   P35     1225.57111
13323   11335   11386   M   P41     1634.436447
13562   11864   11895   M   PENAS   47.884191
13562   11864   11895   M   P35     1228.568357
13562   11864   11895   M   P41     1615.427502
13338   11335   11970   M   PENAS   45.780973
13338   11335   11970   M   P35     1196.32757
13338   11335   11970   M   P41     1561.900145

Предупреждение

Обратите внимание на предупреждение в комментариях от EdMorton о связях с NF.