Не уверен, почему соединение теряется, оно должно работать, если вы вызываете скрипт для его вызова.Однако:
Я бы предложил создать в AAD субъект-службу, связанный с вашей подпиской, и предоставить ему доступ к вашему веб-приложению.Затем вы должны использовать существующую службу приложений Azure. Управление Задачей для запуска / остановки приложения:
Кстати, начиная/ остановка / развертывание веб-приложения должны быть частью определения выпуска / Step - not build.-