У меня была очень похожая проблема, и она оказалась вызвана тем, что fbml не включен по умолчанию . Вместо этого приложения iframes.
Я включил его (в настройках приложения есть выбор радио fbml / iframe) и обнаружил, что есть причина: iframes быстрее.
Документация по iframes в любом случае становится недостаточной и смешанной со страницами, где говорится только о Facebook Connect (очень похоже, если не то же самое, во многих аспектах, да)
Документация Fbml сейчас кажется лучшей.
(И приложения fbml выглядят хорошо с меньшими усилиями)