Если вы используете Express js в качестве сервера, вам не нужно об этом беспокоиться.
Сделайте каталог с именем public или как вы хотите его называть и переместите все CSS, js файлы в него.
И поместите эту строку в файл сценария вашего сервера.
var app = express();
app.use(express.static('public'));
Он будет обслуживать все статические файлы в структуре общих папок,
Если у вас есть какие-либо сомнения, пожалуйста, смотреть это