, поэтому я использую пакет spatstat в R и анализирую изображение маски сегментации TIFF, а также соответствующий планарный точечный рисунок (используя только координаты X, Y центроидов сегментированных объектов).
ДляДля ясности, объект плоской точечной структуры содержит координаты X, Y (центроиды) объектов из изображения сегментации TIFF.Я пытаюсь построить координаты X, Y слоистым образом, который показывает маску и центроиды.
Однако, когда я загружаю изображение TIFF, которое содержит визуальное изображение границы, указывает окно.Размеры изображения в формате TIFF составляют 2800X2800
vim
integer-valued pixel image
2800 x 2800 pixel array (ny, nx)
enclosing rectangle: [0, 2800] x [0, 2800] micrometer
Соответствующие точечные шаблоны варьируются от (X: 2X700) и Y: (2X700).
types$RB
Planar point pattern: 835 points
window: rectangle = [2.1364, 699.1579] x [1.5143, 699.3214] units (one unit = 2 micrometer)
Как выровнять этидва координатных пространства в R с использованием 'spatmat' или другого пакета анализа изображения?
Как выровнять координаты центроидов по маске сегментации?
Я мог бы попытаться изменить масштаб объекта типов $ RB, чтобы он имелте же размеры, что и у изображения TIFF, но на самом деле это не похоже на совпадение.
Обновление: для этого подхода, я думаю, необходимо создать файл формы из файла TIFF.и затем начинайте наложение координат центроидов (X, Y) на файл формы, полученный из графика TIFF.
Таким образом, изображение показывает изображение RGB, и, используя EBImage в R, я могу нарисовать пурпурные / желтые области, которые сегментируют красные пиксели,Однако я не уверен, как создать файл формы и определить координаты.Я могу создавать полигоны (пурпурный / желтый) как нарисованный объект.но мне нужно создать карту многоугольника, похожую на это изображение Филадельфии.Филадельфия - это объект формы с сохраненными в нем атрибутами, но из моего TIFF я могу закрасить только исходный TIFF, но я пытаюсь создать пользовательскую географию из окрашенных областей .