Сводная статистика растра по широтным интервалам - PullRequest
0 голосов
/ 12 октября 2018

Есть ли быстрый способ в R сделать сводную статистику по растру на основе широтных интервалов или бинов.Не сводка всего растрового слоя, а пространственные подразделы.Например, получите среднее и sd значений растровых ячеек для каждых двух градусов по широте.

Ниже приведены некоторые примеры данных спроецированного растра с координатами широта / долгота.

set.seed(2013)
library(raster)

r <- raster(xmn=-110, xmx=-90, ymn=40, ymx=60, ncols=40, nrows=40)
r <- setValues(r, rnorm(1600)) #add values to raster
r[r > -0.2 & r < 0.2] <- NA #add some NA's to resemble real dataset
plot(r)

> r
class       : RasterLayer 
dimensions  : 40, 40, 1600  (nrow, ncol, ncell)
resolution  : 0.5, 0.5  (x, y)
extent      : -110, -90, 40, 60  (xmin, xmax, ymin, ymax)
coord. ref. : +proj=longlat +datum=WGS84 +ellps=WGS84 +towgs84=0,0,0 
data source : in memory
names       : layer 
values      : -3.23261, 2.861592  (min, max)

Ответы [ 2 ]

0 голосов
/ 12 октября 2018

Вы можете объединить свои строки (в данном случае группы из 4) и столбцы (в один столбец)

a <- aggregate(r, c(ncol(r), 4), fun=mean)
b <- aggregate(r, c(ncol(r), 4), fun=sd)

lat <- yFromRow(a, 1:nrow(a))
plot(lat, values(a))
0 голосов
/ 12 октября 2018

Поскольку разрешение вашего растра равно 0,5, а у вас 40 строк, вам нужно mean / sd для каждых 4 строк:

set.seed(2013)
library(raster)

r <- raster(xmn=-110, xmx=-90, ymn=40, ymx=60, ncols=40, nrows=40)
r <- setValues(r, rnorm(1600)) #add values to raster
r[r > -0.2 & r < 0.2] <- NA #add some NA's to resemble real dataset

rmean <- sapply(seq(1,nrow(r),4),function(rix) mean(r[rix:rix+3,],na.rm=T))

rsd <- sapply(seq(1,nrow(r),4),function(rix) sd(r[rix:rix+3,],na.rm=T))


# > rmean
# [1] -0.033134373 -0.180689704  0.176575934 -0.003422832 -0.049113312  0.234891614  0.188559162 -0.026514169  0.106970362
# [10]  0.096033677

Таким образом, вы в основном индексируете растр как матрицу,только используя ломтики, необходимые для mean / sd.Для итерации вы также можете использовать lapply, который помещает все в аккуратный список.

...