Оставив ответ на тот случай, если кто-то может его использовать в будущем.При определении вашей sparkSession используйте метод .config для определения любой конфигурации, которую вы обычно помещаете в spark-defaults.conf, поэтому в этом случае я использовал:
val spark: SparkSession = SparkSession.builder.appName("Simple Application")
.config("spark.master", "local")
.config("spark.neo4j.bolt.password", "mypassowrd")
.getOrCreate()