Скорее всего, вы используете неправильную версию SwiftLint.
На момент написания этой статьи последняя версия 0.25.1
Вы можете увидеть последнюю версию здесь: https://github.com/realm/SwiftLint/releases
Чтобы увидеть, какую версию вы используете: swiftlint version
SwiftLint НЕ установлен через CocoaPods!
Для обновления до последней версии: