Хорошо. Вы можете сделать это:
a) Ссылка на ваши личные сборки в соответствующей папке на жестком диске, например, где они собираются быть установлены
б) Экспортировать проект как шаблон
в) Распакуйте новый zip-файл шаблона
г) Откройте файл .vstemplate.
e) В нижней части узла TemplateContent добавьте узел References, и для каждой ссылки добавьте узел Reference в качестве дочернего элемента References, затем узел Assembly в качестве дочернего элемента этого с именем сборки. Если сборка находится в GAC, я считаю, что вам нужно указать полное имя сборки, но в противном случае, похоже, она будет работать только с именем сборки.
Первоначально, я бы установил переменную пути окружения, которую нужно искать; тем не менее, это оказалось ненужным, так как проекты, построенные по шаблону, работали без него в пути.