Я работаю с DIA данными протеома.Для определения партии я использую pvca-package, для коррекции партии - функцию removeBatchEffect из LIMMA.
Я не нахожу никакой информации, если определение и коррекцию эффекта партии следует выполнять с или безlog2 данных?
Ранее я использовал log2, но поскольку VOON требует данных, не относящихся к log2, мне интересно, верно ли то же самое для анализа и исправления партии.
Спасибо за ваш совет!Себастьян