Сначала split зеленый канал изображения, поместите на него threshold и получите двоичное изображение.Это двоичное изображение содержит объекты зеленой области.Запустите dilating изображение с подходящим ядром, чтобы смежные объекты прилипали друг к другу и становились одним большим объектом.Затем используйте findcontour, чтобы взять размеры всех объектов, затем удерживайте самый большой объект и удалите остальные, это изображение будет вашей маской.Теперь вы можете reconstruct исходное изображение (только зеленый канал) с этой маской и установить прямоугольник на оставшиеся объекты.
Вы можете легко найти код каждой части.