Если вы говорите о CKEditor (версия 3), то есть возможность получить любой экземпляр DOM внутри самого редактора. Каждый экземпляр CKEditor имеет ссылку на свой документ через свойство document.
var documentWrapper = edit.document;
Эта ссылка представляет некоторую общедоступную оболочку для всех узлов CKEditor, но она также имеет прямую ссылку на свой узел. Вы можете получить, получив свойство ["$"].
var documentNode = documentWrapper.$; // or documentWrapper['$'] ;
documentNode будет представлять экземпляр DOM узла документа внутри iframe. Получив экземпляр DOM, вы можете делать со структурой DOM все, что хотите, добавлять, удалять, заменять классы, перестраивать и т. Д.
documentNode.body.className = "zork";
Надеюсь, этого будет достаточно.