Выполните мета-регрессию с помощью модераторов факторов и доверительных интервалов вероятности профиля в R, используя metaplus - PullRequest
0 голосов
/ 23 февраля 2019

Я пытался запустить мета-регрессию в R, используя факторную переменную в качестве единственной модерирующей переменной в модели.Хотя я могу заставить модель работать с использованием таких пакетов, как meta и metafor, ни один из этих пакетов не имеет возможности выбрать вероятность профиля в качестве оценки tau ^ 2 вместо REML или DL.Пакет metaplus был специально разработан для этой цели, но я не могу заставить его работать с факторными переменными.Вот некоторые примеры данных:

trial   author    year tpos  tneg cpos  cneg ablat   alloc      yi     vi             
1      Aronson    1948    4   119   11   128    44    random  -0.8893 0.3256
2      Ferguson   1949    6   300   29   274    55    random  -1.5854 0.1946
3      Rosenthal  1960    3   228   11   209    42    random  -1.3481 0.4154
4      Hart       1977   62  13536  248 12619   52    random  -1.4416 0.0200
5      Frimodt    1973   33  5036   47  5761    13  alternate -0.2175 0.0512
6      Stein      1953  180  1361  372  1079    44  alternate -0.7861 0.0069
7      Vandiviere 1973    8  2537   10   619    19     random -1.6209 0.2230
8      TPT Madras 1980  505 87886  499 87892    13     random  0.0120 0.0040
9      Coetzee    1968   29  7470   45  7232    27     random -0.4694 0.0564
10     Rosenthal  1961   17  1699   65  1600    42 systematic -1.3713 0.0730
11     Comstock   1974  186 50448  141 27197    18 systematic -0.3394 0.0124
12     Comstock   1969    5  2493    3  2338    33 systematic  0.4459 0.5325
13     Comstock   1976   27 16886   29 17825    33 systematic -0.0173 0.0714

yi = суммарный эффект (средняя разница);vi = дисперсия суммарного эффекта

Я хотел бы запустить метарегрессию с выделением в качестве модератора.Среди других попыток вот самый простой код, который я пытался использовать:

res <- metaplus(yi, vi, mods =~ factor(alloc), slab = trial, data = dat)

Ниже приведены сообщения об ошибках, которые я получаю:

Error in rma(yi = yi, sei = sei, mods = as.data.frame(mods), method = "DL") : 
Model matrix contains character variables.

И

Error in as.data.frame.default(mods) : 
cannot coerce class ‘"formula"’ to a data.frame

Я искал переполнение стека и перекрестную проверку и не смог найти решение.Буду очень признателен за некоторые советы по этому поводу.

Спасибо.

...