Как указано на man-странице apt-secure:
Starting with version 0.6, APT contains code that does signature checking of the Release file for all repositories.
Это означает, что если apt не сможет проверить подписи, на которых он не будет работать.Он будет обновляться только если вы укажете --allow-unauthenticated
в apt следующим образом:
sudo apt-get --allow-unauthenticated update