Дублированные ссылки между секторами Circlize Package R - PullRequest
Новая
       39

Дублированные ссылки между секторами Circlize Package R

0 голосов
/ 19 октября 2018

Я пытаюсь использовать Circlize Package для круговой визуализации, но, к сожалению, он дублирует связи между секторами.Это мой набор данных, из которого я хочу узнать, используют ли разные домены один и тот же идентификатор сессии: 

mat <- structure(list(Website = c("domain1", "domain2", "domain3", "domain2", "domain4", 
                                          "domain1", "domain2"), 
                              ClientID = c("xxx", "xxx", "yyy", "yyy", "yyy", "zzz", "zzz"), 
                              SessionId = c("d.0686", "d.0686", "f.1871", "f.1871", "f.1871", 
                                            "n.9210", "n.9210")), 
                         .Names = c("Website", "ClientID", "SessionId"), 
                         row.names = c(NA, -7L), class = "data.frame")


domains <- unique(mat$Website)
output <- matrix(0, length(domains), length(domains))
colnames(output) <- rownames(output) <- domains

for (x in domains) {
  X <- unique(mat[mat$Website == x, 'SessionId'])
  for (y in domains) {
    Y <- unique(mat[mat$Website == y, 'SessionId'])
    output[rownames(output) == x, y] <- length(intersect(X, Y))
  }
}

Затем я строю коврик с помощью circlize () 

chordDiagram(output, annotationTrack = "grid", preAllocateTracks = 1, transparency = 0.5, self.link = 1, symmetric = FALSE)
circos.track(track.index = 1, panel.fun = function(x, y) {
  circos.text(CELL_META$xcenter, CELL_META$ylim[1], CELL_META$sector.index, 
              facing = "clockwise", niceFacing = TRUE, adj = c(0, 0.5), cex = 0.5)
}, bg.border = NA) # here set bg.border to NA is important

К сожалениюпакет circlize () дает мне дублированные ссылки, как вы можете видеть ниже

Plot From mat

Я не понимаю, почему вместо этого дублируются ссылки из матрицыслияния их вместе.Это из-за моих данных (матрица верна для циклического преобразования) или из-за пропущенных параметров при построении циклического графика?

...