R блестящий: renderPlot дублирует значения, ggplot - PullRequest
Новая
       29

R блестящий: renderPlot дублирует значения, ggplot

0 голосов
/ 24 декабря 2018

У меня проблема с реактивным ggplot в Shiny.

необходимые пакеты 

library(shiny)
library(ggplot2)
library(ggthemes)

генерируют набор данных, он содержит недопустимые имена и соответствующее действительное имя 

df_pheno<- data.frame(Species = sample(c("Euthycerina pilosa", "Euthycerina pilosa", "Euthycerina pilosa", "Euthycerina vittithorax", "Euthycerina test")),
Number = sample(c("3", "4", "1", "1", "2")),
Date = sample(c("1", "50", "2", "30", "1")))

df_pheno$Number <- as.numeric(as.character(df_pheno$Number))
df_pheno$Date <- as.numeric(as.character(df_pheno$Date))

simple ui 

ui <- fluidPage(
  sidebarLayout(
    sidebarPanel(
      selectizeInput('validSpecies', 'Choose species', 
                     choices = df_pheno$Species, 
                     options = list(placeholder = 'select species'))
    ),   
    mainPanel(plotOutput("pheno")           
    )
  )
)

сервер, который генерирует реактивный график 

server <- function(input, output, session) {
output$pheno <- renderPlot({
ggplot(df_pheno, aes(x=Date, y= Species == input$validSpecies, fill = Number)) + geom_tile(color="white", size=0.1)+ 
scale_fill_gradient(low="light grey", high="red", name="# specimens", breaks=c(0,1,2,3,4,5), labels=c(0,1,2,3,4,">=5"), limits=c(0,5))+   scale_x_continuous(breaks=c(1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,31,32,33,34,35,36,37,38,39,40,41,42,43,44,45,46,47,48,49,50,51,52), labels=c(1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,31,32,33,34,35,36,37,38,39,40,41,42,43,44,45,46,47,48,49,50,51,52), limits=c(0,53))  + 
coord_equal()+ 
labs(x=NULL, y=NULL, title="Phenology of this species, per week")+
theme(plot.title=element_text(hjust=0.5))+ 
theme(axis.ticks=element_blank())+ 
theme(axis.text.x = element_text(size=7, angle=60)) + 
theme(axis.text.y = element_text(size=7, face = "italic")) + 
theme(legend.title=element_text(size=8)) + 
theme(legend.text=element_text(size=8))    
  })
}

и запускает его 

shinyApp(ui = ui, server = server)

Итак, что я хочу:если вы выбираете определенный вид в selectizeInput, вы генерируете график с данными ТОЛЬКО этого конкретного вида.

что делает этот скрипт: если вы выбираете определенный вид в selectizeInput, он показывает вам (очень хороший) график с двумя видами?!

Я не вижу своей ошибки, хотя,это, вероятно, вполне логично.

Спасибо за вашу помощь, С наилучшими пожеланиями, Джонас

1 Ответ

0 голосов
/ 24 декабря 2018

Я думаю, что в функции вашего сервера, в ggplot, вы должны заменить эту часть 

ggplot(df_pheno, aes(x=Date, y= Species == input$validSpecies, fill = Number))

на эту 

ggplot(data = df_pheno[df_pheno$Species == input$validSpecies,], 
       aes(x = Date, y = Species, fill = Number))

То есть вы должны установить подмножество данных ине та переменная, которую вы отображаете в y.

Также рассмотрите возможность замены длинной последовательности: c(1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,31,32,33,34,35,36,37,38,39,40,41,42,43,44,45,46,47,48,49,50,51,52) на 1:52.

...