Ранг / сортировка панд Python на основе группировки по столбцу из двух столбцов, который отличается для каждого входа - PullRequest
Новая
       8

Ранг / сортировка панд Python на основе группировки по столбцу из двух столбцов, который отличается для каждого входа

0 голосов
/ 22 октября 2018

У меня есть следующий фрейм данных: 

Signature   Genes   Labels  Scores     Annotation  
 CELF1      AARS    0      -5.439356884 EMPTY     
 CELF1      AATF    0      -5.882719549 EMPTY     
 CELF1     ABCF1    0      -6.011462342 EMPTY     
HNRNPC      AARS    0      -6.166240409 EMPTY     
HNRNPC      AATF    0      -6.432658981 EMPTY   
HNRNPC     ABCF1    0      -6.476526092 EMPTY   
   FUS      AARS    0      -5.646015964 EMPTY   
   FUS      AATF    0      -6.224914841 EMPTY    
   FUS     ABCF1    0      -6.395334389 EMPTY

Я хочу ранжировать свой столбец «Счета» на основе в столбце подписи ранга «Гены» на основе столбца Счетов так, чтобы 

Signature   Genes   Labels  Scores     Annotation   Rank 
  CELF1     AARS    0    -5.439356884   EMPTY        1
  CELF1     AATF    0    -5.882719549   EMPTY        2
  CELF1    ABCF1    0    -6.011462342   EMPTY        3
  HNRNPC    AARS    0    -6.166240409   EMPTY        1
  HNRNPC    AATF    0    -6.432658981   EMPTY        2
  HNRNPC    ABCF1   0    -6.476526092   EMPTY        3
   FUS      AARS    0    -5.646015964   EMPTY        1
   FUS      AATF    0   -6.224914841    EMPTY        2
   FUS     ABCF1    0   -6.395334389    EMPTY        3

Я подписался на основе этой записи.Мой код был что-то вроде этого: 

   data=pd.read_csv("trial1.csv",sep='\t')
   data['max_score'] = data.groupby(['Signature','Genes'])['Scores'].transform('max').astype(float)
   data['rank']=data.groupby('Signature')['max_score'].rank()

Однако мои Счета получают ранжирование на основе абсолютных значений, следующим образом: 

  Signature Genes   Labels  Scores       Annotation Rank 
   CELF1    ABCF1      0    -6.011462342    EMPTY    1
   CELF1    AATF       0    -5.882719549    EMPTY    2
   CELF1    AARS       0    -5.439356884    EMPTY    3
  HNRNPC    ABCF1      0    -6.476526092    EMPTY    1
  HNRNPC    AATF       0    -6.432658981    EMPTY    2
  HNRNPC    AARS       0    -6.166240409    EMPTY    3
   FUS      ABCF1      0    -6.395334389    EMPTY    1
   FUS       AATF      0    -6.224914841    EMPTY    2
   FUS       AARS      0    -5.646015964    EMPTY    3

1 Ответ

0 голосов
/ 22 октября 2018

Ранг не сортируется по абсолютному значению.Это сортировка по возрастанию, что по умолчанию.Вам просто нужно изменить свой звонок на rank(), чтобы он был rank(ascending=False).См. документацию .

...