У вас есть только одно уравнение для решения уравнения одновременности.
Например, это работает: -
vars = {x[t], y[t]};
eqns = {x'[t] == y[t], y'[t] == x[t]};
inits = {x[0] == 1, y[0] == 0};
DSolve[eqns, vars, t] // Simplify
sol = vars /. DSolve[Join[eqns, inits], vars, t][[1]]
Plot[sol, {t, 0, 2}]
Но ваше уравнение одновременности недоопределено.
vars = {y[t], y2[t]};
eqns = {y'[t] == k*y[t] + k2*y2[t]};
inits = {y[0] == A, y2[0] == 0};
DSolve[eqns, vars, t] // Simplify
DSolve: Есть больше зависимых переменных, чем уравнений, поэтому система недостаточно определена.