Боюсь, в настоящее время это невозможно.
См. Отслеживание проблемы для более подробной информации.
Вы можете поиграть с заливкой, чтобы принудительно применить уникальное для определенных участников.
A.Configure<Person>()
.Fill(x => x.Id, x => myOwnWayToEnforceUniqueness());
Конечно, это убивает смысл использования библиотеки-насмешки, но может быть полезно, если уникальность не имеет значения для остальных полей.