Rstudio PATH, кажется, поврежден, не может установить пакеты (sed, expr, sh not found) - PullRequest
0 голосов
/ 24 сентября 2019

Возникла некоторая критическая проблема при установке пакетов в Rstudio.Ниже моя попытка установить пакет, который мне нужен.Я пытался установить другие пакеты и получаю похожие ошибки (sed, sh not found и т. Д.).И sed, и bash работают нормально из командной строки, поэтому я предполагаю, что это проблема Rstudio.

Я действительно добавил в etc / path ранее в этот день, возможно, из-за этого (хотя файл кажетсябез изменений).

    > install.packages("igraph")
Installing package into ‘/usr/local/lib/R/3.6/site-library’
(as ‘lib’ is unspecified)
trying URL 'https://cran.rstudio.com/src/contrib/igraph_1.2.4.1.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 2704004 bytes (2.6 MB)
==================================================
downloaded 2.6 MB

* installing *source* package ‘igraph’ ...
** package ‘igraph’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** using staged installation
./configure: line 473: sed: command not found
./configure: line 472: expr: command not found
./configure: line 473: sed: command not found
./configure: line 487: sed: command not found
: error: cannot create .lineno; rerun with a POSIX shell
ERROR: configuration failed for package ‘igraph’
* removing ‘/usr/local/lib/R/3.6/site-library/igraph’
sh: rm: command not found
Warning in install.packages :
  installation of package ‘igraph’ had non-zero exit status

The downloaded source packages are in
    ‘/private/var/folders/ll/jmydhb6n7jqg5rv_c58jxkkh0000gn/T/Rtmpi1rAL3/downloaded_packages’
> 
...