Я никогда не использовал JOGL, но по ссылке это выглядит как API 3D-рисования. Если это так, то общее правило для пользовательского рисунка заключается в том, что вам нужно указать предпочтительный размер панели, на которой вы выполняете пользовательское рисование. Это связано с тем, что полосы прокрутки появляются только тогда, когда предпочтительный размер панели больше, чем размер области прокрутки. Когда появятся полосы прокрутки, ваш слушатель должен работать.