Матрица расстояний в k-прототипах clustMixType

Question

Привет всем. Я пытаюсь получить матрицу расстояний при использовании пакета clustMixType R. В частности, при использовании функции kproto (x, ...) вывод дает мне столбец с именем «кластер», который представляет собой вектор членства в кластере, и другие столбцы, называемые дисцами. (I) [Матрица с расстояниями наблюдений до всех прототипов кластера] где i - количество результирующих кластеров, например следующий фрейм данных:

#        cluster        dists.1     dists.2    dists.3
#1       1             0.04763169  0.6398194  0.75879754
#2       1             1.65313658  1.3228020  0.31168919
#3       2             0.47583030  0.6636173  0.03983268
#4       ..             ...         ...        ...

, но, насколько мне известно, это не матрица расстояний, например:

[
    [0, 2, 3],
    [2, 0, 4],
    [3, 4, 0] ]

Я хочузнать, можно ли вывести матрицу расстояний из выходных данных R

Спасибо

Answer 1

Используйте функцию dist для вычисления матрицы парных расстояний.

kproto выполняет кластеризацию прототипов. Вероятно, он не использует попарные расстояния, только для прототипов.