Где я могу найти пример файла workflow.rst для генерации отчетов о змейке? - PullRequest
1 голос
/ 18 октября 2019

Я пытаюсь использовать функцию отчетности snakemake, которая описана здесь: https://snakemake.readthedocs.io/en/stable/snakefiles/reporting.html

Однако мне трудно найти содержательный пример того, как должен выглядеть файл workflow.rst.

Я посмотрел пример вывода https://koesterlab.github.io/resources/report.html

, но не могу найти код для создания этого отчета.

1 Ответ

1 голос
/ 19 октября 2019

Кажется, что ссылка в документации не работает.

Я нашел пример в тестах snakemake:

https://github.com/snakemake/snakemake/tree/master/tests/test_report

Файл snake, генерирующий отчетесть: https://github.com/snakemake/snakemake/blob/master/tests/test_report/Snakefile

Используется следующий файл .rst: https://github.com/snakemake/snakemake/blob/master/tests/test_report/report/workflow.rst

...