Итак, я выполнил пост-тест Тьюки для двухстороннего ANOVA с использованием HSD.test агролы и TukeyHSD .
HSD.test дал мне комбинации характеристик, их средние значения y, стандартное отклонение, минимальное, максимальное и квартильное значения. Затем он объединяет комбинации признаков в группы A, B, BC и C, основываясь на сходствах и различиях. Когда я излагаю их, он показывает средние и стандартные отклонения каждой группы.
a3=aov(Delta.~Loc*between, data=m3)
tx <- with(m3, interaction(Loc, between))
amod <- aov(Delta.~tx, data=m3)
library(agricolae)
HSD.test(amod, "tx", group=TRUE)
TukeyHSD сравнивает внутри каждой функции, а затем сравнивает комбинации функций. Для каждого сравнения он дает разницу нижнего и верхнего диапазонов и скорректированные значения p. Если я построю эти данные, то получу 95-процентный доверительный интервал для каждого сравнения, и будет много пробелов.
TukeyHSD(a3)
Как узнать, какой пакет теста Тьюки использовать? Есть ли другие? Если я использую TukeyHSD, могу ли я отбросить все пустые сравнения?